CDA Evaluation modèle prédictif pKa : resp. P. Krezel ICOA
Ressources SPGoO : PK, YS
Objectif : Permettre l’évaluation du ou des pKa pour une molécule donnée à l’aide d’un outil utilisant l’ IA.
Description du travail à produire : ce travail va se dérouler en plusieurs étapes qui vont passer par l’évaluation de l’état de l’art qui consistera à trouver les approches existantes et d’en faire la synthèse.
La deuxième étape consistera à construire une solution complète et opérationnelle pour ce calcul.
Etape 1 : repérage de l’existant et analyse des solutions :
| Nom | lien | Date de publi. | |
| 1 | MolGpka | https://github.com/Xundrug/MolGpKa/tree/master | |
| 2 | Unipka | https://github.com/dptech-corp/Uni-pKa | |
| 3 | mol_property | https://github.com/TVect/mol_property/tree/master | |
| 4 | pka_lookup | https://github.com/khoivan88/pka_lookup | |
| 5 | Graph-Pka | https://pka.simm.ac.cn/en/page/help/ | |
| 6 | OPERA | https://github.com/kmansouri/OPERA/tree/master | |
| 7 | GR-pKa | https://academic.oup.com/bib/article/25/5/bbae408/7738659 | 09/2024 |
| 8 | dimorphite_dl | https://github.com/UnixJunkie/dimorphite_dl/tree/master |
Analyse de la solution MolGpka :
Détail de la mise en oeuvre de cette solution.
Analyse de la solution Unipka :
Détail de la mise en oeuvre de cette solution.
Analyse de la solution Mol-property :
Détail de la mise en oeuvre de cette solution.
Analyse de la solution pka_loopup :
Détail de la mise en oeuvre de cette solution.
Analyse de la solution Graph-Pka :
Détail de la mise en oeuvre de cette solution.
Analyse de la solution OPERA :
Détail de la mise en oeuvre de cette solution.
Analyse de la solution GR-pka :
Détail de la mise en oeuvre de cette solution.
Analyse de la solution dimorphite_dl:
Etape 2 : élaboration d’une solution
Description des solutions connues et maîtrisées